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Immunity:北大蒋争凡课题组发现 STING 后高尔基体囊泡转运的重要性及机制

2023/3/16 16:57:28  阅读:135 发布者:

cGAS-STING 通路是负责识别胞质 DNA 免疫应答的主要通路 1cGAS 作为胞质 DNA 受体,可以被 DNA /Mn2+ 激活并利用 ATP GTP 合成第二信使 2'3'-cGAMP,后者进一步激活 STING 并诱导 I 型干扰素等细胞因子的产生,从而介导抗病毒/肿瘤免疫反应。研究表明多种病原微生物入侵及各种压力胁迫,如氧化应激、代谢紊乱及 DNA 损伤等都可导致胞质 DNA 的累积及 Mn2+ 浓度的升高,从而激活 cGAS-STING 通路。因此,cGAS-STING 信号通路在抵抗病原微生物感染、肿瘤及多种免疫相关疾病的发生及治疗中都发挥关键作用。

磷脂酰肌醇磷酸(phosphoinositides, PIPs)是构成真核生物细胞膜组分的重要磷脂(占总磷脂的 5-10%),也是重要的信号分子 2。由于肌醇六元环上 D-3D-4 D-5 位都可发生磷酸化修饰,因此真核生物中总共存在 7 种不同 PIP 分子。PI4Pphosphatydyinositol 4-phosphate)是胞内含量最高的 PIP 分子,广泛分布于各种膜组分,且在反式高尔基体(trans-Golgi network, TGN)上的含量最高。细胞中的 PI4P 的含量主要受其合成酶 PI4Ks (PI4KA, PI4KB, PI4K2A PI4K2B) 和降解酶 SAC1 的调控。PI4P 不仅是合成 PIP2 PIP3 的前体,也是重要的信号分子,在膜泡运输、脂质转运和细胞器形态维持等方面发挥关键作用。

2021 年蒋争凡实验室利用 STING 自激活突变体诱导细胞死亡的特性,在 HT080 细胞中进行了基于 CRISPR-Cas9 介导的全基因组筛选,发现高尔基体腔内合成的硫酸化糖胺聚糖(sGAGs)可以通过结合到 STING 跨膜区的腔内侧,从而诱导 STING 的寡聚及激活 3。该论文的讨论部分提到 STING sGAGs 的相互作用受到 STING 腔内侧 pH 值的调控,并由此推测 STING pH 更低的后高尔基体囊泡(post-Golgi vesicles)中会有更高的活性。但是在这个研究中,他们没有解释 STING 为什么需要及如何转运到后高尔基体囊泡。

2023 3 14 日,北京大学生命科学学院蒋争凡实验室在 Immunity 上以 research article 形式在线发表了 ARMH3-mediated recruitment of PI4KB directs Golgi-to-endosome trafficking and activation of the antiviral effector STING,报道了 ARMH3 作为接头蛋白招募 PI4KB STINGPI4KB 通过合成 PI4P 促进 STING 从高尔基体到内体的转运(Golgi-to-endosome trafficking)及维持 STING 激活所需要的脂膜环境(lipid environment),从而帮助 STING 更加稳定高效的激活。

本工作首先通过 CRISPR-Cas9 介导的全基因组筛选在 HeLa 细胞系中鉴定到一个未知功能的新基因 C10ORF76  (又名 ARMH3)  STING 的激活十分重要。ARMH3 是一个鲜少被研究的蛋白,为数不多的几篇文章暗示了它对于 PI4KB 发挥激酶活性来磷酸化磷脂酰肌醇(phosphatidylinositolPI)生成 PI4P 十分重要。免疫荧光实验发现 STING 激活后和 ARMH3PI4KB PI4P 都在反式高尔基体有明显的共定位。进一步免疫共沉淀实验显示,STING 只有在 ARMH3 存在的情况下和 PI4KB 有互作,表明 ARMH3 STING PI4KB 之间起到桥梁作用。

进一步实验表明 ARMH3 分别结合位于 STING 第二、三跨膜区直之间的连接区域及位于 PI4KB 激酶结构域中间的连接区域。突变掉 STING 负责结合 ARMH3 的氨基酸或者利用 CRISPR-Cas9 原位删除 PI4KB ARMH3 互作的关键区域(6 个氨基酸残基)都会显著削弱 cGAS-STING 通路的激活。这些结果表明 ARMH3 招募 PI4KB 对于 STING 的激活十分关键。

更重要的是,细胞内敲除 ARMH3 或者原位删除 PI4KB 结合 ARMH3 所需的 6 个氨基酸,STING 在上游通路活化后几乎呈现完全的内质网定位,暗示如果 2'3'-cGAMP 结合后被转运到高尔基体的 STING 无法被继续转运到后高尔基体囊泡,将会被细胞内 COPI/AP1 介导的从高尔基体向内质网的逆向转运运回内质网,并完全抑制 STING 的活化。

为了更直接的研究 PI4KB STING 激活的影响,他们使用雷帕霉素诱导的 FKBP FRB 相互作用,直接招募 PI4KB-GFP-FKBP STING-mCherry-FRB,并发现招募 PI4KB STING 会显著促进 STING 聚集体的形成及下游信号通路的激活,且这种对于 STING 通路的激活能力完全依赖于 PI4KB 的激酶活性。相反,招募 PI4P 的磷酸酶 SAC1 STING 则会抑制 STING 聚集体的形成及下游信号通路的激活。表明 PI4KB 通过在 STING 周围合成 PI4P 促进 STING 的激活。有趣的是,SAC1 的敲低会引起的细胞内 PI4P 水平的异常升高,进而导致 STING 不依赖于 cGAS 的自激活。TMEM39A 是一个自身免疫性疾病相关基因且被报道参与细胞内的 PI4P 水平的调控 4。同样,TMEM39A 的敲低也会导致细胞内 PI4P 的水平的异常升高及 STING 的自激活,该发现有助于理解 TMEM39A 相关自身免疫疾病的致病机制。此外,SCAP NPC1 的突变也被报道可以引起细胞内 PI4P 的水平的异常升高及 STING 的自激活 5-8,提示胞内 PI4P 水平的异常升高可能是这些基因突变导致 STING 自激活的共同原因。

为了研究 PI4P 如何影响 STING 的激活,他们对 23 PI4P 结合蛋白进行了系统性地敲低并发现其中 9 个成员的降低表达会使 STING 的激活严重受损。功能分析表明这 9 PI4P 结合蛋白可以分为两类。其中 AP-1 GGA2 负责介导高尔基体到内体的膜泡运输。由于内体中相对更低的 pH 值有利于 STING sGAGs 的结合,他们推测 PI4P 可以通过指导 AP-1 GGA2 介导的 clathrin-coated vesicles (CCVs) STING 从高尔基体转运到内体从而避免 STING 被运回内质网,并且更加强烈激活 STING。另一类 PI4P 结合蛋白均为脂质转运蛋白,其中 OSBP ORPs 负责从内质网向高尔基体或内体转运胆固醇,CERT 负责神经酰胺从内质网到高尔基体的转运。神经酰胺在高尔基体上会在 SGSM1 的催化下转化为鞘磷脂,且 SGSM1 在细胞内的敲除会显著削弱 STING 的激活,提示鞘磷脂而非神经酰胺直接作用于 STING。通过特异的化学小分子破坏胆固醇和鞘磷脂在脂膜上的分布会使 STING 聚集体逐渐消散并显著抑制 STING 下游信号通路的激活,表明胆固醇和鞘磷脂对 STING 聚集体的形成和激活十分关键。以上结果共同表明 PI4P 还可以通过脂质转运蛋白维持 STING 活化所需的脂膜环境进而影响 STING 的激活。此外,Lyz-Cre 介导的 Armh3 条件敲除小鼠实验表明 Armh3 在机体对抗 DNA 病毒感染过程中发挥关键作用。

综上所述,该研究发现:

1STING 为什么需要离开及如何离开高尔基体(后高尔基体转运)的分子机制(下图);

2)一个未知功能的接头蛋白 ARMH3(可能还具有 GEF 活性,激活膜泡转运中非常重要的 Small GTPase Arf1)在 cGAS-STING 通路中的重要作用;

3)脂膜环境对 STING 的活化十分关键及必要;

4)细胞内 PI4P 水平的异常升高可以导致非依赖于 cGAS STING 蛋白自激活(cGAS-independent STING autoactivation)。

重要的是,这种现象在很多脂质代谢紊乱的自身免疫病患者中被发现及报道。鉴于 PI4P 在脂质运输及脂质稳态维持中的核心作用,他们的研究还提示 STING 作为一个潜在的细胞脂质稳态感受器(lipid homeostasis sensor),可能是细胞内的一种新型危险信号感受器。

北京大学生科院博士后方润和蒋启飞为该文章的共同第一作者,2022 级研究生贾新颖也为本研究做出贡献。生科院/北大-清华生命科学联合中心的蒋争凡教授为通讯作者。

原文链接:

https://doi.org/10.1016/j.immuni.2023.02.004

转自:“丁香学术”微信公众号

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