2022/3/10 9:35:29 阅读:3060 发布者:chichi77
本期介绍使用文献管理软件EndNote去除重复文献的技巧
note: 本期预计阅读时间5分钟
背景
系统综述/荟萃分析/meta分析的研究步骤包括:1.确定问题——2.文献检索——3.筛选文献——4.质量评估——5.数据提取——6.综合分析
IWH systematic review steps and stakeholder engagement
我们以一篇高分发表的文章为例子,介绍了2.文献检索的步骤,感兴趣的请戳:
从一个实例说说文献检索的二三事|meta分析
介绍了02.文献检索中数据库的选择
如何选择检索数据库|荟萃分析
本期着重介绍一下检索导出文献后的步骤——去除重复文献
在介绍数据库的推文中,我们了解到不同数据库可能包含相同的出版物和文献,因此检索后需要去除重复文献,以得到唯一的文献记录。去重的步骤需要在PRISMA 流程图中体现,记录具体重复数。
PRISMA 流程图
下面以文献管理软件EndNote 20(Mac 版本)为例(其它系统和版本操作类似),讲解具体操作
EndNote文献去重步骤
第一步 导入原始文献记录
假设我们已经将文献检索后的结果导出,存放到EndNote文献库中
按照个人习惯,我会新建一个群组(group set)存放原始记录,将不同数据库下载的文献记录分别存放在不同组(group),并记录文献数量
导入原始文献记录|EndNote
这时再新建一个群组(group set)用于去重,群组下新建一个组(以下简称唯一组)将所有原始记录复制到新的群组中,以免误删
新建群组和组|EndNote
第二步 初步去重
选定唯一组中所有文献(command+A),在菜单栏——数据库(Library)——查找重复文献(Find Duplicates)
查找重复文献|EndNote
这一步操作后,会弹出重复文献的对话框,这时直接选择取消(Cancel)
查找重复文献|EndNote
这时如果不选择取消,会需要手动一篇篇确定在2篇重复文献中确认需要保留的文献
点击取消后则界面回到文献列表,会发现重复的文献被高亮了
查找重复文献|EndNote
将重复文献统一添加到重复组
另存重复文献|EndNote
并将重复文献在唯一组中删除(不是直接扔进垃圾桶!)
删除组中重复文献|EndNote
第三步 修改去重规则
打开菜单栏——偏好设置——重复(Duplicates)
EndNote可以通过作者、年份、标题、杂志、卷、期、页码等信息比较文献是否重复
默认重复的判断规则为“作者、发表年份、标题、文献类型”一致的文献
修改去重规则|EndNote
这时可能因为检索数据库收录规则不一样,导入的“作者、发表年份、标题、文献类型”信息不全或格式不一,而遗漏很多重复文献
因此我们可以修改规则,比如只勾选“作者、标题”,或者“作者、年份、杂志、卷”等较宽泛的定义
比如我们只选择“作者、标题”,并保存设置
修改去重规则|EndNote
再次进行第二步中去重的操作——
选定唯一组中所有文献(command+A),在菜单栏——数据库(Library)——查找重复文献(Find Duplicates),
弹出重复文献的对话框,这时直接选择取消(Cancel)
重要的步骤来了——先右键将所有可疑重复文献设为“已读”
修改去重规则|EndNote
逐条手动检查文献是否重复,如有实际上未重复的文献,则将其标记为“未读”
文献检查完后,将唯一组的文献按是否已读排序
修改去重规则|EndNote
这时将“已读”文献移动到重复组
修改去重规则|EndNote
并将重复文献在唯一组中删除(不是直接扔进垃圾桶!)
随后,重复第三步操作,修改不同“作者、年份、标题、杂志、卷、期、页码”的排列组合,手动逐条检查,即可得到相对干净的唯一文献
第四步 记录去重结果
记录重复组的文献数量,填写在PRISMA流程图中
最后,就可以继续在唯一组进行文献筛选操作
之前推文介绍了2个辅助 筛选文献 的工具,感兴趣的请戳:
轻巧解决META分析的摘要筛选 | Rayyan教程
Meta分析筛选文献的一把好手—— Covidence 安利贴
总结
本期介绍了使用文献管理软件EndNote进行文献去重的操作——包括4个主要步骤:
导入文献
初步去重
修改EndNote的去重规则,手动检查
记录去重结果
References:
www.prisma-statement.org
来源:EndNote|我亲手截图
封面:自制
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