上周发布了哪些“结构”文章？又取得了哪些科研进展？
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2022.8.29~2022.9.04
CNS刊登文章
01
Nature
2022/08/31
“Structures of a phycobilisome in light-harvesting and photoprotected states”
藻胆体 (PBS) 结构可以看作蓝藻和红藻中精致的触角，这些大型蛋白质复合物捕获入射阳光，并通过称为色素团（bilin）的嵌入色素分子网络将能量转移到光合反应中心。然而，光收集也必须与光损伤的风险相平衡。一种已知的光保护模式是由橙色类胡萝卜素蛋白 (OCP) 介导的，当光强度高时，它会与 PBS 结合从而介导光保护以及非光化学猝灭。来自密歇根州立大学的Cheryl A. Kerfeld课题组使用冷冻电镜以蓝藻（Synechocystis sp. PCC 6803） 为模型解析了6.2MDa的 PBS 的四种结构，分别是结合或者不结合OCP。该结构包含以前未描述过的衔接蛋白，该蛋白与 PBS面向细胞膜的一侧相结合。对于未淬灭的 PBS，研究还揭示了触角三种不同构象状态，其中两种是以前未知的。不同的构象状态是由两个杆的位置转换引起的，并且可能构成一种新的光捕获调节模式。三种 PBS 构象中只有一种可以与 OCP 结合，这表明并非每种 PBS 都同样容易受到非光化学猝灭的影响。在 OCP-PBS 复合物中，淬灭是通过结合四个 34kDa 的OCP 来实现的，这些 OCP 形成两个二聚体。该复合物揭示了 OCP激活态的结构，其中其调节羧基末端结构域发生了大约 60 Å 的位移。最后，通过将结构与光谱特性相结合，研究阐明了 PBS 在淬灭和光捕获状态下的能量转移途径。总的来说，该研究为阐明控制蓝藻光捕获的生物物理机制提供了详细的见解。
原文链接
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05156-4
02
Science
2022/09/01
“Cyclic ADP ribose isomers: Production, chemical structures, and immune signaling”
环状 ADP 核糖 (cADPR) 异构体是细菌和植物Toll/IL-1 受体 (TIR) 结构域通过 NAD+ 水解产生的信号分子。来自澳大利亚昆士兰大学的Bostjan Kobe和格里菲斯大学Thomas Ve课题组合作表明 v-cADPR (2'cADPR) 和 v2-cADPR (3'cADPR) 异构体通过 ADPR中核糖基之间形成的 O-糖苷键而环化。产生 2'cADPR 的 TIR 结构域的结构显示了导致活性组装的构象变化，这与Toll样受体适应体TIR结构域的构象变化相似。基因突变揭示了一个环化所必需的保守色氨酸。研究表明，3'cADPR 是来自细菌抗噬菌体防御系统的 ThsA 效应蛋白的激活因子，并且当由效应蛋白HopAM1 产生时，它是植物免疫的抑制因子。总的来说，本项研究结果揭示了 cADPR 异构体产生的分子基础，并在细菌中确立了 3'cADPR 作为抗病毒和植物免疫抑制信号分子的作用。
原文链接
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adc8969
03
Cell
2022/09/02
“Convergent evolution in the supercoiling of prokaryotic flagellar filaments”
细菌和古细菌鞭毛丝的超螺旋是运动所必需的。古细菌鞭毛丝与其细菌对应物没有同源性，而是细菌 IV 型菌毛的同源物。这些由数千个相同亚基组成的原核生物的鞭毛丝如何在扭转应力下形成稳定的超螺旋，这始终是一个令人困惑的问题，还没有明确的结构基础来解释。现在冷冻电镜 (cryo-EM) 技术的进步可以使超螺旋结构直接可视化，来自美国弗吉尼亚大学的Edward H. Egelman课题组解析了超螺旋细菌和古细菌鞭毛丝的原子结构。对于细菌鞭毛丝，研究确定了 11 种不同的原丝构象，具有三大类原聚体的界面。对于古菌鞭毛丝，10 条原丝形成由 10 种不同构象支持的超螺旋形状，一个原聚体间的不连续在曲线内部形成一条接缝。研究结果表明，趋同进化产生了稳定的超螺旋几何形状，使微生物能够正常运动。
原文链接
https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(22)00996-5
2022.8.29~2022.9.04
子刊刊登文章
01
Cell Research
9.1
“Cofactor-assisted dicing: insights from structural snapshots”
9.1
“Author Correction: Cryo-EM structure of the AVP–vasopressin receptor 2–Gs signaling complex”
02
Molecular Cell
9.1
“Structure of the RAF1-HSP90-CDC37 complex reveals the basis of RAF1 regulation”
03
Nature Structural & Molecular Biology
9.1
“The DNA-damage kinase ATR activates the FANCD2-FANCI clamp by priming it for ubiquitination”
04
Nature Communications
8.29
“Invariant surface glycoprotein 65 of Trypanosoma brucei is a complement C3 receptor”
8.29
“Structure of a nucleosome-bound MuvB transcription factor complex reveals DNA remodelling”
8.30
“Proteolytic processing induces a conformational switch required for antibacterial toxin delivery”
8.30
“Structural bases for aspartate recognition and polymerization efficiency of cyanobacterial cyanophycin synthetase”
8.30
“Structure and dynamics of Toll immunoreceptor activation in the mosquito Aedes aegypti”
8.30
“Structural basis for shape-selective recognition and aminoacylation of a D-armless human mitochondrial tRNA”
8.31
“Structural basis of ion uptake in copper-transporting P1B-type ATPases”
8.31
“Structural and mechanistic basis for recognition of alternative tRNA precursor substrates by bacterial ribonuclease P”
9.2
“Structural basis for Gemin5 decamer-mediated mRNA binding”
9.2
“Rtt105 regulates RPA function by configurationally stapling the flexible domains”
9.2
“Proton-driven alternating access in a spinster lipid transporter”
9.3
“X-ray crystallographic characterization of the SARS-CoV-2 main protease polyprotein cleavage sites essential for viral processing and maturation”
05
Science Advances
8.31
“Structural insights into crista junction formation by the Mic60-Mic19 complex”
9.2
“Structure of the vasopressin hormone–V2 receptor–β-arrestin1 ternary complex”
9.2
“Structure and mechanism for streptococcal fatty acid kinase (Fak) system dedicated to host fatty acid scavenging”
转自：“水木未来资讯”微信公众号
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