论文通过了系统查重，答辩时却被导师指出有重复部分，该怎么办？

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第一，保持冷静和礼貌，虚心听取老师指出的问题。认真记录老师提到的具体重复内容和相关意见。

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第二，针对老师指出的重复部分，当场进行解释说明。如果确实存在理解上的偏差或表述不当导致被误认为重复，详细阐述这些部分的真正含义和写作思路，说明其与已有文献的差异。

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第三，承诺会对老师指出的问题进行进一步的核实和修改。表明会以严谨的态度对待，确保论文的质量和原创性。

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第四，在答辩结束后，立即对论文中被指出的可能重复部分进行深入研究和重新审视。如果确实存在重复，进行细致的修改和完善，确保论文在内容上真正做到原创和独特。

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第五，与导师及时沟通，汇报答辩时的情况以及自己后续的修改计划，寻求导师的指导和建议，以更好地完成论文的完善工作。

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在修改完成后，可以请导师或其他专业人士再次审阅，确认问题已得到妥善解决，避免类似情况再次发生。

总之，要以积极的态度面对问题，及时采取有效措施解决，以保证论文的质量和学术诚信。

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