学术论文除了严谨的语言表述，图表呈现也是非常重要的一部分。高质量的图片，会大大提升论文的可读性（legibility）和可信度（reliability）。制作精良的图片，会让编辑和审稿人看的赏心悦目，大大提升论文的接受率。相反，粗制滥做的图片，会让编辑和审稿人看的糟心，拉低论文的质量。
随着学术内卷，近些年来论文的一个发展趋势是一篇论文中需要支撑结论的图片数量增多了，而且图片的制作要求也越来越高，清晰度、设计、配色等等，有的期刊还要求提供摘要图Graphical abstract(摘要图)，大刊的杂志社如Cell甚至有专门的负责图片美化的编辑。
一篇论文中Figures总的呈现原则，还是逻辑性。一篇文章需要几个论点支撑，每个论点1-2张图，每张图又需要几张分图，每张分图分别用了什么实验来说明什么问题。这是需要提前设计好的。
图片的类型主要有三大类：统计图、照片和示意图。其中，统计图又分为柱状图、散点图、线图、饼图等。照片有荧光细胞图、各类电镜图、Western/Southern/Northern等条带图。示意图有流程图、3D建模、信号通路图。
1 下面我们先介绍一下各类图片的主要要素
统计图：是对所测量数据的一个总结性呈现，一般表现出一定的规律。比如实验组和对照组之间的显著差异，测量值随时间或处理浓度增加的一个线性变化关系（time/concentration dependent）。以柱状图为例，它的五个要素：坐标轴刻度尺、坐标轴文字说明、图例说明、Error bar、P value都是非常重要的元素。坐标轴刻度的设置要合理且和文中对应，比如X轴的处理时间，经常有同学的取样时间和Materials部分不一致，要留意。
线图、散点图和柱状图是为了说明随着X轴条件的变化，Y轴数值的对应变化规律。饼图则是为了说明在一个大的整体中，各部分所占比例的不同。
照片图是最有力的证据，所见即所得。在生物医学类论文中常见的有荧光细胞图、各类电镜图、Western/Southern/Northern等条带图。照片类图因为是非矢量图，所以要特别注意清晰度，一般要求300 dpi以上。这个在拍摄制作的时候要设置好分辨率，后期只能调低不能调高，人为调高dpi对图像画质并没有提升。
电镜图片要有说明文字、Scale bar或放大倍数的标识；
各类检测DNA/RNA/蛋白的Western/Southern/Northern印记图对每一个泳道都要有标识文字，有Marker条带，内参GAPDH/β-actin等。
示意图根据用途不同，有流程图、3D建模、信号通路图等呈现形式。
图片制作和输出过程中涉及很多细节，每个期刊的Author Instructions部分也有关于Figure规定的大段描述。作者在投稿之前要仔细阅读并上传相应规定的figure。
通用规则包括图片输出格式、尺寸、字体、文字大小、线条粗细、配色等。
期刊一般要求的图片格式是TIFF或PDF。统计图最好存成pdf矢量格式，文件小还能无限放大不损失画质，照片图一般输出为TIFF，要求300-600 dpi，不超过10M。
图片尺寸：根据占据页面版式不同，可以分为半栏（不超过8 cm）、2/3栏（12-15 cm）和通栏（15-18 cm）。字体一般是Arial或Times New Roman，Times New Roman有的笔画会非常细，缩小了显示为断线。建议用Arial。文字大小在6-12 pt之间，分图标识最大，内部标识文字稍小，不能小于6 pt；
一个大图之内的分图构图要紧凑，尽量拼成方方正正的大图，说明同一组或对比数据的及张分图放在一起（比如不同细胞系或不同细胞因子结果）。分图之间上下左右的间距要合适均匀（一般0.5 cm）。
线条的粗细在各个图之间要统一。包括坐标轴的线条和其他框线。一般1 pt左右。
更好的期刊还要求配色和谐。一般不建议用高饱和色系，考虑红绿色盲人群要避开红绿对比。此外，在同一篇文章中涉及的变量，在各个图之间要保持色系统一。一个便捷方法是同学们可以存一些顶刊的高级配色图，自己作图的时候用吸色笔直接调用。
2 例文解析
我们以一篇PLOS Pathogens论文为例，选取Figure 1来剖析一下
这张图包含了三种类型的图片，包括示意图、柱状图和照片图。每种图片的构成元素很完备，示意图的元素说明，柱状图的坐标轴文字标识和显著性差异标识，照片的文字标识以及比例尺。3张分图合起来是为了说明VLP RBD疫苗的设计（A分图）、构建和鉴定（B和C）。
Figure caption中的文字说明。首句点明了整张图的主旨“SARS-CoV-2 VLP RBD疫苗的设计、构建和鉴定”。请注意，Figure caption是写结论，不是实验过程。分图AB是示意图和电镜照片，所见即所得，没有需要详细说明的。C图是一个ELISA检测，结果用统计图中的柱状图展示。所以，有简单的实验过程描述。Figure caption中的实验过程描述目的是为了让读者更快get你的实验结果，所以描述要“详细但又不要太过详细”。关于实验温度、反应时长、浓度等详细过程不需要写。但是，实验所用的实验对象个数、统计方法、P值界定、实验重复次数等需要写明。
Caption中的时态，首句总结性结论可以用一般过去时或一般现在时，实验过程介绍是一般过去时。全文Figure captions时态要保持一致。还有一点，一篇论文中涉及的几组对比变量，在不同的Figure中要保持颜色一致。比如本文的RBD/VLP-RBD-M/VLP-RBD-B/PBS分别用了黑红蓝黄，在Figure 2/3/4/5中都是如此。便于读者理解。
3 避坑指南
3.1 图片类型选择不准确
一组数据应该用什么类型的图来呈现，柱状图、折线图、散点图、照片还是流程图？这是要提前想好的。如前所述，柱状图、折线图等是对一组数据规律的统计性呈现，而照片、示意图等则是所见即所得的直观呈现。
我们看看这个图，作者声称是实验组和对照组比较，出现了“Depression, lethargy, respiratory distress, limb paralysis, diarrhea, Moribund or death”等病症。但在图中，我们只能看到两组小鼠大小不同。所以，这种图用照片就不能全面反映数据特征。换成下面的柱状统计图就完美解决问题。
3.2 对数据的呈现不准确
数据点后面的长尾是怎么得来的？为什么是向下并趋于平缓？
更正后：
还有下面的：
纵坐标不可能有负数的RNA占比。这些都是软件默认设置。在输入数据生成图片之后，一定要检查一下各要素是否准确，包括坐标轴、折现或柱状图等。
3.3 图片信息不完整
图片要具备自明性“self-explanatory”，读者结合图片和caption，不需要看正文，就能完全明白你在说什么。
统计图中，要注意横纵坐标标识要清楚，图例不要缺失。
如上图A，纵坐标测的是什么的表达量？实际上左图是mRNA，右图是protein的相对表达量。改成下图就清楚了。
更正后：
照片图中，为了让读者更好的get图片信息，该有的文字、符号说明，要标示清楚。
以下是2021年PLOS Biology上的一篇论文（Creating clear and informative image-based figures for scientific publications），调查了生物学领域500多篇论文的图片展示情况。
如果图中背景信息很多，关键信息需要用各种标识或文字做注释，比如箭头、圆圈、三角或字母代号等。如下图，是根据文章内容需要，同一张图，由少到多的注释方式：
（同时有些细节要注意，比如注释的颜色与背景色要能很好区分，箭头和框线位置要精准，指示线不能有交叉，图中注释和不同颜色在legend中是否又解释。）
3.4 数据和Results不一致
这个一般是在统计图中，或是Table中。比如，图中展示的是样品处理后12、24、36、48和60小时的数据，Results部分介绍是12、24、36、48和72小时。
有的柱状图中两组对比数据看似有显著性差异，Results部分的结论是not significant。加图
还有饼图的百分比，要和Results部分数据对应。我们经常在改稿子的时候，发现图中和正文用的是两套数据。这些会让编辑和审稿人觉得很不严谨。数据不一致还挺常见的，提醒大家在投稿之前要把正文各处和图表数据一定要核对一遍。
4 关于Figure legend的Do和NOT Do
前面我们说过，Figure legend是对Figure的总结和解释说明。一般来说第一句话是总结Figure的结论。后面是对Figure的简要说明。这个说明要有，但是也不能像Methods中一样过于冗长。
Figure legend部分容易出现的问题有以下几种：
4.1 第一句话介绍实验结论而非描述实验内容。
第一句话一定是直接给出实验结论。很多作者很随意，直接复制粘贴Methods中的内容。
例如“ELISA and enzyme-linked immunospot (ELISPOT) assays were performed with isolated splenocytes from immunized mice. ”这种读者看了，完全不能get你这张图要说明什么问题。
换成“A induced cytokine responses at levels comparable to B in immunized mice.”就直接明了。
4.2 分图说明不能没有细节，也不能太过详细。
特别是统计图。要有实验对象和方法的简要描述。“Growth dynamics of XX in MDCK cells.” (which method? was performed to test the YY 12, 24, 36, 48 and 60 hours post infection.) ”
但是也不需要太过详细。说，就是与结果无关的细节不需要交代，比如样品的保存、处理、反应温度等。这些放在Methods中。
Analysis of the XX protein blocked to react with YY by the positive sera for ZZ using the cELISA, in which the dried plates and the fusion were both stored at 4℃ for different times.
4.3 描述性结论不要放在caption而是正文中。
对Figure结果的详细描述不需要出现在caption中。
“Cell morphology analyses by transmission electron microscopy. A XX was treated with 20 µL 2 mg/mL P560dep. The surface of XX was smooth, and “capsule-stripped” YY were generated; B XX was treated with 20 µL PBS (as control). The surface of XX treated with PBS was rough.” 这些描述图片细节的文字可以放到正文。
还有统计图对于结果的解读，上升下降趋势等等，是不需要在caption中呈现的。
Significant differences in the prevalence rates for XX and YY were observed (P < 0.05). (b) There were no significant changes in the prevalence for any genotype (P > 0.05).
4.4 这些容易缺失的因素要注意。
内参、P value、每组实验动物只数等要交代清楚。
GAPDH and β-actin were used as the internal control for RT-qPCR and Western blotting, respectively.
梯度稀释或系列剂量要给出具体数值（如果Materials and Methods未说明）。
缩写要给出全称。
What means Z1-Z6?
以上就是娜姐改了100多篇稿子，总结出来的SCI论文中需要注意的规范和容易犯的错误，希望大家都能get到SCI论文图片的精髓，让数据能说话，帮助自己的论文更具可信度和逻辑性。
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