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天津医科大学杨吉龙/李祥春/陈可欣通过单细胞测序分析揭示肢端黑色素瘤的肿瘤异质性和免疫环境

2022/12/12 11:15:57  阅读:281 发布者:

肢端黑色素瘤是黑色素瘤的一种令人沮丧的亚型,发生在无毛的肢端皮肤中,在东亚人的发病率较高。

20221125日,天津医科大学杨吉龙、李祥春及陈可欣共同通讯在Nature Communications 发表题为“A single-cell analysis reveals tumor heterogeneity and immune environment of acral melanoma”的研究论文,该研究从5个肢端和3个皮肤黑色素瘤样本中获得的63394个细胞进行单细胞RNA测序,以研究肿瘤异质性和免疫环境。定义了5个功能细胞簇,它们参与TGF-β信号传导、I型干扰素、Wnt信号传导、细胞周期和胆固醇外排信号传导。

富集TGF-β、I型干扰素和胆固醇外排信号传导信号与黑色素瘤的良好预后显著相关。与皮肤黑色素瘤相比,肢端黑色素瘤样本具有明显的严重免疫抑制状态,包括细胞毒性CD8+ T细胞耗竭,Treg细胞富集和CD8+ T细胞耗尽。PD1TIM-3在肢端黑色素瘤的详尽CD8+ T细胞中具有更高的表达。总之,该研究有助于更好地了解肢端黑色素瘤。

肢端黑色素瘤(AM)是在肢端皮肤发展的一种黑色素瘤亚型。虽然AM的绝对发病率很少见,但它约占东亚黑色素瘤病例的50%AM具有以结构重排和扩增为特征的遗传景观,并且没有皮肤黑色素瘤(CM)的紫外线特征。然而,一项II期临床试验表明,伊马替尼对KIT突变的AM无效。

最近的研究表明,抗PD1治疗AM的效果较差,而抗PD-1免疫治疗可将黑色素瘤的客观缓解率提高到38%,但对于AM,它只有16.6%。尽管AM的基因组特征已在几项研究中进行了深入探索,但尚不清楚为什么AM对免疫治疗反应不佳。因此,需要通过其他更准确的方法,如单细胞测序,从肿瘤异质性和免疫环境等其他方面进一步探索AM的内在特征。

黑色素瘤的生态环境由肿瘤细胞、免疫细胞、成纤维细胞和内皮细胞等组成。单细胞测序为解剖黑色素瘤的肿瘤环境提供了前所未有的机会。近年来,许多研究致力于探索黑色素瘤的免疫环境和肿瘤异质性。然而,AM的单细胞转录组分析仍然不可用。因此,该研究打算探索AM的微环境。

在这项研究中,进行了单细胞测序,以系统地研究AMCM患者的肿瘤异质性和免疫环境。研究发现AMCM患者的表达特征为TGF-β信号传导,I型干扰素,Wnt信号传导,细胞周期和胆固醇外排信号的表达特征。与CM患者相比,AM患者的特征是严重的免疫抑制状态,主要发现在两个独立的数据集中得到验证。

来自免疫抵抗性肢端黑色素瘤患者的治疗前和治疗后样本的差异(图源自Nature Communications

总之,这项研究能够更好地了解AMCM在免疫和肿瘤表型方面的肿瘤生态系统异质性。该结果可以成为宝贵的资源,有助于更深入地了解与AM相关的机制,并有助于为AM患者的免疫疗法开发更有效的治疗靶点和生物标志物。

参考消息:

https://doi.org/10.1038/s41467-022-34877-3

转自:iNature”微信公众号

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