上周发布了哪些“结构”文章？又取得了哪些科研进展？
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2022.10.31~2022.11.06
CNS刊登文章
01
Science
2022/11/03
1.“RNA-activated protein cleavage with a CRISPR-associated endopeptidase”
CRISPR-Cas系统通过RNA引导的核酸酶活性在原核生物中提供针对外来遗传元件侵袭的适应性免疫反应。最近，在与CRISPR系统的遗传关联中发现了其他具有非核酸酶功能的基因，这表明可能存在其他RNA引导的非核酸酶。隶属于Class I家族的Type III-E亚型效应蛋白Cas7-11是类特殊的CRISPR系统，系统内多效应亚基融合形成一个巨大的单亚基，命名为gRAMP（Giant Repeat Associated Mysterious Protein）。与gRAMP基因位点邻近有THP/CHAT蛋白酶（Csx29），可与gRAMP形成复合物。可爱龙团队揭示了Cas7-11通过gRNA靶向激活蛋白酶Csx29，Csx29蛋白酶对同样位于邻近的底物Csx30进行切割。
来自麻省理工学院霍华德·休斯医学研究所的张锋和Strecker团队合作证明了这种CRISPR相关蛋白酶（CASP）对sigma因子抑制剂表现出可编程的RNA激活内肽酶活性，以调节转录反应，同时他们解析的处在活性状态下和底物结合的CASP复合物的冷冻电镜结构揭示了一种变构激活机制，该机制在靶RNA结合时重组Csx29催化残基。这项工作揭示了自然界中RNA引导的功能，可用于体外和人类细胞中的RNA传感应用。
原文链接
https://www.science.org/doi/10.1126/science.add7450
2022/11/03
2.“RNA-triggered protein cleavage and cell growth arrest by the type III-E CRISPR nuclease-protease”
III-E CRISPR-Cas7-11型效应子结合CRISPR RNA（crRNA）和假定的蛋白酶Csx29，并催化crRNA引导的RNA切割。来自东京大学Nishimasu课题组和来自MIT的Gootenberg以及Abudayyeh课题组合作分别解析了结合和未结合靶RNA的Cas7-11-crRNA-Csx29复合物的冷冻电镜结构，揭示了靶RNA结合诱导Csx29的构象变化。生化实验揭示了Csx29对辅助蛋白Csx30的靶RNA依赖性切割的作用。细菌中系统的重建表明，Csx30裂解可以产生有毒的蛋白质片段，导致生长停滞，这是由 Csx31 调节的。Csx30 结合 Csx31 和相关的 sigma 因子 RpoE会调控细胞生长速度，表明 Csx30 介导的 RpoE 抑制调节是细胞对感染的反应。作者们设计了Cas7-11-Csx29-Csx30系统，用于哺乳动物细胞中的可编程RNA传感。总之，本研究证明了Cas7-11-Csx29效应子是一种RNA依赖性核酸酶-蛋白酶系统。
原文链接
https://www.science.org/doi/10.1126/science.add7347
Nature
本周无
Cell
本周无
2022.10.31~2022.11.06
子刊刊登文章
01
Cell Research
11.03
1.“Molecular recognition of itch-associated neuropeptides by bombesin receptors”
02
Nature Structural & Molecular Biology
11.03
1.“AAA+ protease-adaptor structures reveal altered conformations and ring specialization”
03
Nature Communications
11.02
1.“Structural dynamics of DNA strand break sensing by PARP-1 at a single-molecule level”
11.03
2. “Endowing homodimeric carbamoyltransferase GdmN with iterative functions through structural characterization and mechanistic studies”
11.03
3.“Structural insights into the contactin 1 – neurofascin 155 adhesion complex”
11.05
4.“A biomimetic electrostatic assistance for guiding and promoting N-terminal protein chemical modification”
11.05
5.“Structure insights into selective coupling of G protein subtypes by a class B G protein-coupled receptor”
04
Science Advances
11.02
1.“Lipids mediate supramolecular outer membrane protein assembly in bacteria”
转自：“水木未来资讯”微信公众号
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