基因编辑 | 北大科院科研团队合作开发新型碱基编辑器Td-CBE

近日，北京大学生命科学学院伊成器课题组和合作者联合在Nature Biotechnology杂志上在线发表了题为“Re-engineering the adenine deaminase TadA-8e for efficient and specific CRISPR-based cytosine base editing”的研究成果。该项研究通过在TadA-8e腺嘌呤脱氨酶中引入N46L突变，成功将其转变为专一且高效的胞嘧啶脱氨酶，并以此为基础开发了新型的碱基编辑器Td-CGBE与Td-CBEs。

相比于传统的基于AID/APOBEC家族的CGBE/CBE碱基编辑器，Td-CGBE/CBEs编辑器在编辑活性与之类似的情况下，展现出更窄的编辑窗口和更低的插入、缺失副产物等编辑特性。同时，利用之前开发的全基因组、无偏好性的脱靶检测技术Detect-seq，对Td-CBEs编辑器进行了脱靶评估。

评估发现，Td-CBEs在全基因组水平所造成的脱靶位点要远少于同等编辑活性的传统CBEs；虽然Td-CBEs与传统碱基编辑器BE4max基于不同的脱氨酶构建，但Td-CBEs相比于BE4max不会产生新的脱靶位点。值得注意的是，Td-CBEs也并不会产生之前课题组发现的两类新型脱靶编辑（out-of-protospacer edits与target-strand edits）。

利用Detect-seq技术对Td-CBEs进行脱靶检测与评估

以上结果表明，Td-CBEs是一种较传统CBEs更为安全的碱基编辑器，为未来遗传疾病的基因治疗带来了更大的可能。同时，Detect-seq作为一种平台技术，可以为开发更安全、高效的基因编辑工具提供强有力的支持与帮助。

来源：北京大学生命科学学院

原文链接：https://www.nature.com/articles/s41587-022-01532-7

转自：“威斯腾生命科学研究院”微信公众号

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