王炸！2万+个基因“一键筛选”，再也不怕课题没思路了！

课题没思路怎么办？那就Screen啊，各种筛选，这是湿实验里常用的思路，但是这种方法得有财力人力，那普通科研者如何做到海量的筛选呢？

当然是运用生物信息学技能啦，比如使用临床生信之家的批量分析工具！零编程，鼠标点击，即可实现20000+个基因预后的批量筛选！

第一步：进入官网首页直接选择“批量分析”工具即可。

批量筛选可以大幅提高课题效率，提供针对20000+全基因的生存分析批量，基因相关性分析。你再也不必用湿实验来筛选了，如果你暂时没有什么idea，那么可以尝试全基因批量生存分析，一次性20000个基因，从中挑选出一些某个肿瘤预后相关基因，之后可以借鉴单基因分析套路将它丰富起来，如从表达层面，表观层面，蛋白层面，突变层面，免疫层面等多角度多数据联合分析，总之有了这个工具，你不怕没有课题思路！

如果你已经找到关注的某个基因，那么可以尝试批量相关性分析，找到还有哪些基因可能跟它较为相似，进而另外一篇单基因的课题就出炉啦

近期，临床生信之家在功能和界面上都有了彻底的升级，这里我们将不同公开数据库以及代表性的功能分析划分为独立模块，如图，同时也可以去交流区去互动或者视频教程区观看教程，后续会将一起其他公共数据库整合进来，如CCLE，TARGET等。

第一个是TCGA数据库（The cancer genome atlas，癌症基因组图谱）， 收录了各种人类癌症（包括亚型在内的肿瘤）的临床数据，基因组变异，mRNA表达，miRNA表达，甲基化等数据，是癌症研究者很重要的数据来源。在这里我们对TCGA数据库所有33种肿瘤进行可视化分析，既可以根据特定临床信息、某基因突变或表达量高低进行样本筛选，也可以根据分析类型分为单组，多组，复杂分析。

第二个是GEO数据库（GENE EXPRESSION OMNIBUS），收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。在这里集成数据集筛选(中英文对照)、针对样本信息的关键词筛选；一键实现探针ID转换、去批次效应，数据标准化。可进行包括差异基因、基因相关性和免疫检查点等在内的分析。需要注意的是与TCGA不同的地方，数据并没有指定好，需要用户根据关键字检索数据集，收录到我的样本库然后才可以进行功能分析。

另一个是泛癌分析（Pan-cancer），目前针对TCGA的33种肿瘤类型进行泛癌分析，包括预后，表达，免疫相关性，突变等分析。这里我们可以选择“全部肿瘤”将33种肿瘤全部纳入一并分析，也可以自主选择特定肿瘤，如食管，胃，结直肠消化系统小泛癌一起分析。

大家还有其他什么想法，可以在“交流区”留言，我们有专职人员汇总大家提出的宝贵意见，以此完善提升平台功能和Bug。

转自：“谷粉学术”微信公众号

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