海蛇海洋适应性的基因组密码 | BMC Biology

发表期刊：BMC Biology

论文标题：新的染色体级基因组为了解海蛇（Hydrophis: Elapidae）的海洋适应性提供了线索

(New chromosome-scale genomes provide insights into marine adaptations of sea snakes (Hydrophis: Elapidae))

通讯作者：Alastair J. Ludington；Kate L. Sanders

第一作者：Alastair J. Ludington

DOI：10.1186/s12915-023-01772-2

发表日期：2023年12月8日

背景

重大的演化转变，如从陆地生境到海洋生境的转变，为了解适应性背后的基因组机制提供了有力的机会。海蛇在过去约 1500 万年中经历了从陆地到海洋的完全过渡，但它们仍然是脊椎动物海洋适应性分子研究中的一个明显空白。

结果

在这项研究中，我们组装和注释了四个新的海蛇基因组，其中三个是染色体级的（Hydrophis major、H. ornatus 和 H. curtus），并对海蛇属及其陆生近缘种进行了详细的比较基因组分析。

系统发生组分析凸显了海蛇（系统发生树）根部近乎同时发生物种分化的可能性，同源图谱显示了染色体内的变化，这将是该系统的未来适应和形成基因组研究的重要靶标。

然后，我们对海蛇属（以七个陆生蛇基因组为背景）进行了严格的正向选择筛选，以确定在缺氧适应、感官知觉、免疫反应和形态发育方面代表性过高的基因。

结论

我们为多育且在医学上具有重要意义的眼镜蛇科适应辐射提供了目前可用的最佳参考基因组。我们的分析凸显了海蛇属内部系统发育的复杂性和基因组结构的保守性。正向筛选的海洋相关基因为将来的功能研究提供了有希望的候选基因，将基因特征与海蛇和其他脊椎动物的海洋表型相关联。

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New chromosome-scale genomes provide insights into marine adaptations of sea snakes (Hydrophis: Elapidae)

转自：“BMC科研永不止步”微信公众号

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