英国伯明翰大学全奖博士招生

英国伯明翰大学Prof Helen Cooper组招募全奖博士（国际学生可申）

结构生物学的新工具：天然环境质谱

米德兰综合生物科学培训伙伴关系

首席导师：Helen CooperLink教授开启新窗口

(http://www.biosciences-labs.bham.ac.uk/cooper/#tdsub)

联席主管：Iain Styles

博士项目名称：结构生物学新工具：原生环境质谱

注册大学：伯明翰大学

项目大纲

天然环境质谱（NAMS）是一个新兴的领域，能够直接从蛋白质及其复合物的生理环境中对其进行无标记表征。NAMS有潜力成为结构生物学的强大工具。例如，NAMS有可能直接从组织本身提供蛋白质-药物复合物或病理性蛋白质聚集体的结构信息，如阿尔茨海默病中发现的蛋白质聚集体，从而对基本生物学过程提供前所未有的见解。更重要的是，NAMS以空间定义的方式提供这些信息。也就是说，NAMS可以应用于质谱成像。NAMS的好处可以通过考虑药物治疗肿瘤的薄组织切片来说明。原则上，NAMS将告知药物-靶标相互作用（即药物是否与正确的蛋白质结合？）和药物-靶标交互作用的位置（即蛋白质-药物复合物是否在肿瘤或健康组织中？）。

库珀实验室处于NAMS研究的前沿，已经证明可以通过两种互补的技术从组织切片中提取完整的蛋白质复合物：液体提取表面分析（LESA）1，2和纳米喷雾解吸电喷雾电离（nano-DESI）3，4尽管取得了这些有希望的结果，但提取天然蛋白质的潜在机制仍不清楚，最佳采样和分析条件也是如此。该项目的目的是解决这些问题，并进一步开发这些技术，用于一系列组织类型的NAMS。该研究还将涉及离子迁移率光谱技术与NAMS技术的集成，以进一步提高性能。将开发用于数据分析的计算工具（蛋白质识别和质谱成像数据集的可视化）。

参考文献

1.Hale，O.J.等人，《美国科学院质谱学杂志》。，2020年，3873-879。

2.Griffiths，R.L.等人，《国际质谱杂志》。，2017年，437，23-29。

3.Hale，O.J.等人，直接来自晶状体组织的完整膜蛋白质组装体和可溶性蛋白质组装体的天然环境质谱法。2022年：伯明翰大学电子数据库。

4.Sisley，E.K.等人，《美国化学杂志》。Soc.，2022，1442120-2128。

BBSRC战略研究重点：了解生命规律——结构生物学

项目期间将采用的技术

质谱法

液体萃取表面分析（LESA）

纳米喷雾解吸电喷雾电离（Nano DESI）

离子迁移率光谱法（FAIMS、TWIMS）

生物信息学工具、可视化软件工具

联系方式

联系人：Helen Cooper教授

电子邮件：h.j.cooper@bham.ac.uk

团队主页：http://www.biosciences-labs.bham.ac.uk/cooper/

转自：“科研doge”微信公众号

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