孟德尔随机化之分析流程

过往几期，我们了解了孟德尔随机化MR分析原理、工具变量的选取以及核心假设，今天我们继续来了解一下MR分析流程：

Ø读取暴露因素的GWAS数据。

Ø选取合适的工具

统称设置为P＜ 5×10-8，必要时进行clumping。

Ø读取结局变量的GWAS数据

提取上述工具变量的SNP（变异频率大于1%的单核苷酸变异）。

Ø数据预处理

对暴露因素与结局的GWAS数据进行预处理，使其格式统一化。

ØMR分析SNPs与结局的关系

默认使用五种方法为MR Egger，Weighted median，Inverse variance weighted，Simple mode ，Weighted mode，多用效应值（β）或者风险值（OR）表示。

Ø分析结果可视化

包括散点图、森林图和漏斗图等，散点图斜率代表暴露因素对结局的影响大小（causal effect）。

转自：“朗盟医学”微信公众号

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