野生啮齿动物补体系统的平衡选择 | BMC Ecology and Evolution

发表期刊：BMC Ecology and Evolution

论文标题：野生啮齿动物补体系统的平衡选择 (Balancing selection on the complement system of a wild rodent)

通讯作者兼第一作者：Mridula Nandakumar

DOI：10.1186/s12862-023-02122-0

发表日期：2023年5月25日

背景

病原体施加的选择压力可以影响宿主的遗传多样性模式。尤其在免疫系统中，许多基因编码与病原体拮抗相互作用的蛋白质，为共同进化铺平道路，从而通过平衡选择增加遗传多样性。补体系统是先天免疫的关键组成部分。许多补体蛋白质直接与病原体相互作用，或通过识别病原体分子以激活补体，或作为病原体免疫逃避机制的靶点。因此，可以推断补体基因是病原体介导的平衡选择的重要靶标，但对免疫系统这一部分的此类选择的分析一直受限。

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结果

利用来自野生堤岸田鼠的全基因组重测序数据的种群样本（n = 31），我们估计了遗传多样性程度，并检测了多个补体基因（n = 44）的平衡选择特征。与蛋白质编码基因的全基因组平均值相比，补体基因显示出更高的标准化β值（在平衡选择下预计此数值会增加）。补体基因FCNA，一种与病原体直接相互作用的模式识别分子，在Hudson-Kreitman-Aguadé（HKA）测试中显示出平衡选择的特征。对该基因的局部平衡选择特征的扫描表明，平衡选择的靶点位于与配体结合有关的外显子区域。

结论

这项研究进一步证实了平衡选择可能是先天免疫系统组分中的重要进化动力。补体系统中筛选的靶标符合预期，即平衡选择作用于与病原体直接相互作用蛋白质的编码基因。

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Balancing selection on the complement system of a wild rodent

转自：“BMC科研永不止步”微信公众号

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