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孟德尔随机化联合转录组分析,“双疾病”另类思路!

2023/8/22 11:16:08  阅读:174 发布者:

202384日在Journal of Translational Medicine杂志发表“Mendelian randomization and transcriptomic analysis reveal an inverse causal relationship between Alzheimer's disease and cancer”文章(IF7.393),揭示了AD可能会降低癌症风险,证明了AD对癌症的因果影响,并提供了两种疾病之间的潜在分子联系。

研究背景

阿尔茨海默病(AD)和癌症是常见的与年龄有关的疾病,流行病学证据表明它们之间存在反比关系。然而,对它们之间关系的潜在机制的研究仍然不足。

主要方法

基于GWAS目录中42034AD患者和609951例癌症患者的全基因组关联汇总统计,采用双样本孟德尔随机化(MR)方法。此外,利用两步磁共振鉴定了AD和癌症之间的代谢物。还采用共定位分析方法鉴定基因的上调是AD的危险因素,并通过分析33TCGA癌症类型的转录组学数据,证明这些基因的上调是癌症的有利预后因素。

研究结果

双样本磁共振分析显示,AD风险增加对癌症风险降低有显著的因果影响。两步磁共振分析发现,极低密度脂蛋白(VLDL)是AD与癌症负相关因果关系的关键中介。共定位分析发现PVRIG上调是AD的一个危险因素。转录组学分析显示,PVRIG表达与泛癌和多癌类型的干性评分呈显著负相关,与抗肿瘤免疫应答和总生存率呈正相关。

总结

AD可能会降低癌症风险。VLDL是将AD与癌症联系起来的重要中间变量。PVRIG丰度是AD的危险因素,但也是癌症的保护因素。这项研究证明了AD对癌症的因果影响,并提供了两种疾病之间的潜在分子联系。但也存在一定的局限性:没有对PVRIG的抑瘤作用进行实验验证;VLDL作为AD与癌症之间的中介作用有待实验和临床数据进一步证实;免疫是否是AD与癌症之间关系的关键因素值得探讨。

转自:“朗盟医学”微信公众号

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