孟德尔随机化选题|双疾病方向只需简单的分析套路就能发9+,就是这么刚
2023/8/10 17:10:35 阅读:233 发布者:
孟德尔随机化方法是一种将基线信息用于分组,以获得更加可靠的因果推断结果的统计学方法。它被应用于医学、社会科学、环境科学等多个领域中,成为了判断因果效应的黄金标准。“双疾病分析”方向作为孟德尔随机化分析的热点,主打就是“高性价比”。
今天小盟带大家学习一篇9+的。
阿尔茨海默病(AD)和癫痫之间孟德尔随机化分析
Alzheimer Disease and Epilepsy: A Mendelian Randomization Study
发表时间:2023.7
影响因子:9.9
期刊名称:Neurology
研究背景和方法
观察性研究表明阿尔茨海默病(AD)和癫痫之间存在双向关系。然而,因果关系是否存在以及在哪个方向上存在仍存在争议。本研究旨在通过2样本双向孟德尔随机化(MR)方法探讨AD的遗传易感性、AD的CSF生物标志物(β-淀粉样蛋白[Aβ]42和磷酸化tau[pTau])与癫痫之间的关系。
本研究使用的遗传工具来自对AD(Ncase/proxy=111326,Ncontrol=677663)、AD的CSF生物标志物(Aβ42和pTau,N=13116)和欧洲血统的癫痫(Ncase=15212,Ncontrol=29677)的大规模全基因组荟萃分析。癫痫表型包括所有癫痫、全身性癫痫、局灶性癫痫、儿童缺席癫痫、青少年缺席癫痫、少年肌阵挛性癫痫、全身癫痫伴强直阵挛发作、局灶癫痫伴海马硬化症(局灶性HS)和病变阴性局灶性痫性。主要分析使用基于广义汇总数据的MR进行。敏感性分析包括逆方差加权、MR多效性残差和和异常值、MR Egger、加权模式和加权中值。
主要结果
AD的遗传易感性与局灶性HS风险升高相关(OR=1.013,95%CI:1.004~1.022,PGSMR=0.004),广泛的灵敏度分析在幅度和方向上产生了类似的估计(PIWW=0.001,PMR-PRESSO=0.003,P加权中值=0.011,P加权模式=0.056)(图1)。为了进一步验证AD和局灶性HS之间的关联,我们使用Lambert等人早期AD GWAS数据集的工具性SNPs进行了复制分析,该数据集不包括代理病例。结果表明,在大小和方向上存在相似的因果效应(PGSMR=0.009,PIWW=0.020,PMR-PRESSO=0.033,P加权中位数=0.005,P加权中值=0.029),进一步验证了因果关系(图2)。
此外,AD与全身性癫痫的风险增加有关(OR=1.053,95%CI:1.003~1.105,PGSMR=0.038)。敏感性分析在幅度和方向上得出了类似的估计(PIWW=0.025,PMR-PRESSO=0.035,P加权中位数=0.061,P加权模式=0.079)(图3)。没有证据表明多效性(PEgger截距=0.480;PMR-PRESSO全局检验=0.661)或异质性(PIWW_Q=0.659,Q=0.634)。
CSF Aβ42和pTau对癫痫的影响如图4所示。较低的CSF Aβ42与全身性癫痫的风险增加有关(β=0.090,95%可信区间:0.022~0.158,PGSMR=0.010)。敏感性分析表明,在幅度和方向上有相似的估计(PIWW=0.014,PMR-PRESSO=3E-4,P加权中位数=0.021,P加权模式=0.139)。没有发现多效性(PEgger截距=0.298;PMR-PRESSO全局检验=0.996)或异质性(PIWW_Q=0.975,PEgger_Q=0.993)的证据。此外,使用不同水平的GWAS显著性阈值(5e-8,5e-6)和聚集阈值,GSMR估计的关联在方向和大小上是一致的(图5)。
总结
目前的MR研究支持AD、淀粉样蛋白病理学和全身性癫痫之间的因果关系。这项研究还表明,AD与伴有海马硬化的局灶性癫痫之间存在密切联系。应该进一步来筛查AD中的癫痫发作,揭示其临床意义,并探索其作为一个假定的可改变风险因素的作用。
转自:“朗盟医学”微信公众号
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