【综述】揭开植物中ncRNA编码肽的秘密：挖掘方法和研究进展的综述

非编码RNA在生物体中扮演着重要的角色，但“非编码”这个词限制了人们的思维方式，所以被理所当然地认为不具备编码蛋白的能力。然而，近年来的研究表明，生物体中的非编码RNA不仅可以编码肽，而且编码的肽具有重要的生物学意义。

近日，International Journal of Biological Macromolecules在线发表了大连理工大学栾雨时教授课题组题为“Unveiling the Secrets of Non-coding RNA-encoded Peptides in Plants: A Comprehensive Review of Mining Methods and Research Progress”的综述，系统地总结了目前植物中非编码RNA编码肽（ncPEPs）的挖掘方法、类别以及生物学功能。

首先，该文归纳整理了目前关于ncPEPs的多种预测方法（图1），如转录组学、翻译组学及蛋白组学等多种技术手段，并总结了它们的优势和局限性。同时，阐述了目前研究中鉴定ncPEPs内源性常用方法。

进而，该文总结了不同植物中各类别ncPEPs的产生过程及其可能的作用方式（图2），并阐述了不同种类ncPEPs在植物中发挥的重要生物学功能（图3）。

最后，该文提出了仍需丞待解决的问题，如：具有编码潜力的ncRNAs特征尚不明了；ncPEPs的作用机制还未完全清楚；不同ncPEPs最适外源施用的浓度范围仍不确定等等。

时至今日，ncPEPs的发现数量如同“冰山一角”，其在植物生长发育过程中的作用仍有待探索。相信在不久的将来，通过进一步的挖掘研究，将会发现更多具有重要生物学意义的ncPEPs，相关的研究成果也有望为农林业的绿色可持续发展提供良好的理论基础。该工作得到了国家自然科学基金项目的支持。

论文链接：

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813023018469

转自：“iPlants”微信公众号

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