Mil Med Res：新冠康复者治愈后1年的口腔和肠道微生物组及血浆代谢组特征

自新型冠状病毒肺炎（COVID-19）爆发以来，截至2022年8月1日，全球累计确诊人数已超过5.7亿人，累计治愈人数已超过5.4亿人。COVID-19引起的病理生理变化可对身体产生长期影响并引发持续的症状。研究表明COVID-19重症患者出院后3个月内仍有严重肺功能损害的症状。对COVID-19患者进行6个月的随访发现，疲劳、睡眠障碍、感觉障碍、呼吸困难是最常见的后遗症。因此，持续关注新冠肺炎康复者的健康状况是有重要临床意义的。人类微生物组和代谢组的变化与多种疾病密切相关。已有研究表明新冠肺炎患者的口腔和肠道微生物组及血浆代谢组特征发生了显著改变。然而，通过一年的康复期，新冠肺炎康复者的微生物组和代谢组特征及其恢复程度仍是未知的。郑州大学第一附属医院余祖江/任志刚团队对COVID-19康复者进行了一年期随访，对口腔和肠道微生物组以及血浆代谢组进行了表征，并鉴定了COVID-19康复者恢复过程中的关键微生物和代谢物。该文章发表在《Military Medical Research》（IF:34.915）杂志。

研究者招募了35名COVID-19确诊患者和160名健康对照者。COVID-19患者在治愈出院时和1年后随访时留下标本，共前瞻性地收集497份样本，其中舌苔样本219份，粪便样本129份，血浆样本149份。舌苔和粪便样本进行16S rRNA Mesiq测序，血浆样本采用高效液相色谱-质谱进行非靶向代谢组学检测。

研究设计流程图

结果表明与治愈出院时相比，康复者一年后的口腔和肠道菌群及血浆代谢组学特征均有较大程度的恢复，但并未完全恢复正常。在COVID-19的恢复过程中，口腔和肠道微生物组的多样性逐渐增加。其中产丁酸菌和益生菌逐渐增加，而产脂多糖的细菌逐渐减少。

口腔菌群特征的逐渐恢复

肠道菌群特征的逐渐恢复

此外，血浆中PE（15:0/16:1（9Z））、色氨酸甜菜碱和邻苯二酚硫酸盐等代谢物的丰度逐渐增加，而（±）18-HEPE、Quinquenoside F1、5（S）-HpETE等代谢物的丰度逐渐降低。同时，与COVID-19的炎症因子风暴密切相关的1-磷脂鞘氨醇（S1P）在恢复过程中逐渐增加。其次，基于确诊患者治愈出院时的口腔和肠道微生物及血浆代谢物建立的一年后中和抗体预测模型分别达到了90.48%、85.71%和87.04%的预测效率。

血浆代谢组学特征的逐渐恢复

最后，COVID-19恢复过程中关键口腔和肠道微生物及血浆代谢物的Spearman相关性分析表明血浆中S1P的丰度与肠道中粪杆菌属、双歧杆菌属、毛螺菌属的丰度，和口腔中消化链球菌属和链球菌属的丰度呈正相关，与口腔中伯克霍尔德菌目的丰度呈负相关。

逐渐恢复过程中关键口腔微生物、肠道微生物和血浆代谢物之间的相关性

该研究首次对COVID-19一年期康复者的口腔和肠道微生物组和血浆代谢组进行了表征，并鉴定了COVID-19恢复过程中的关键微生物和代谢物。此外，基于微生物和代谢物的预测模型为预测COVID-19康复者中和抗体水平提供了新工具。该研究为促进COVID-19康复提供了新靶点和新策略。

文献引用格式：

Guang-Ying Cui, Ben-Chen Rao, Zhao-Hai Zeng, Xue-Mei Wang, Tong Ren, Hai-Yu Wang, Hong Luo, Hong-Yan Ren, Chao Liu, Su-Ying Ding, Jun-Jie Tan, Zhen-Guo Liu, Ya-Wen Zou, Zhi-Gang Ren & Zu-Jiang Yu.  Characterization of oral and gut microbiome and plasma metabolomics in COVID-19 patients after 1-year follow-up. Military Medical Research, volume 9, Article number: 32, (2022) .

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https://mmrjournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40779-022-00387-y

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