重磅：高福院士团队Nature发表新冠病毒起源研究！

以下文章来源于生命科学前沿 ，作者病毒学

由新冠病毒SARS-CoV-2引发的COVID-19疫情于2019年12月爆发，并在此后的三年里在造成了全球性传染病疫情。据世卫组织统计，截至目前新冠导致了超过7亿人感染，680万人死亡。但迄今为止，关于新冠病毒的起源，具体是如何传播到人类的仍不确定。

4月5日，中国疾病预防控制中心（CDC）高福院士团队在《nature》杂志上发表了一份期待已久的分析报告。报告题为“Surveillance of SARS-CoV-2 at the Huanan Seafood Market ”。该报告涉及新冠大流行的最初几周在中国武汉华南海鲜市场收集的拭子，以及国际科学界自疫情开始以来一直呼吁的基本数据。

研究证实，来自华南海鲜市场的拭子含有来自野生动物的遗传物质，并且对SARS-CoV-2检测呈阳性。这表明，动物有可能是病毒的中间宿主，而病毒溢出后感染了人类。但是文章中，研究人员也认为，最新的发现仍然没有明确的证据证明SARS-CoV-2来源于一个从动物到人类的溢出事件。

值得注意的是，这篇论文是对这些市场样本进行的一系列公开分析中的最新一篇，也是第一篇经过同行评审的论文。该研究结果与之前的预印本文章分析一致，即这些棉签含有来自野生动物和SARS-CoV-2的基因数据。但是这些环境样本并不能证实在场的任何动物都感染了病毒。

据报道，一些早期的人类新冠感染病例曾有过华南海鲜市场接触史。自2020年1月1日市场关闭后，研究人员从环境中收集了923个样品。自1月18日起，从18种动物中收集了457个样本，包括冰箱和冰柜中未售出的物品、流浪动物的拭子和鱼缸中的物品。

在海鲜市场及周边地区采集的923份环境样本中，实时荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)检测SARS-CoV-2阳性73份，阳性率为7.9%。RT-PCR的循环阈值(CT)范围为23.9~41.7。

在海鲜市场内部的828份样本中，64份样本(7.7%)为阳性。在海鲜市场内采集到的64份新冠病毒阳性样本中，87.5%(56/64)的样本集中在该市场西区，尤其是从第1街到第2街的街道，其中71.4%(40/56)的样本为阳性。

在与海鲜市场有关的仓库的14份样品中，有5份检测为阳性。这可能反映了疫情早期市场上存在SARS-CoV-2的遗传物质。在海鲜市场以外周边地区的51个污水井样本中，有3个检测结果呈阳性。值得注意的是，2020年1月在市场采集的30个环境样本中，有一个样本(Env_0601)的地板表面拭子检测结果也呈阳性。从该市场的下水道或污水井采集的110份样本中，有24份样本的SARS-CoV-2核酸呈阳性。市场上的全部四口污水井经检测均呈阳性。

在对海鲜市场地上排水路径的现场调查中，研究人员发现，地上废水进入市场内部的地下，然后流入市场边缘的井中。然后，研究人员对所有地上排水沟进行抽样。感染者上呼吸道的排泄物和动物粪便混合在一起进入排水沟。因此，这些数据表明，要么是市场中受感染的人和/或动物污染了污水，或被污染的污水可能进一步在市场病例集群内发挥了促进病毒传播的作用。

此外，研究成功分离出三种活病毒。市场上的病毒与人类分离物HCoV-19/Wuhan/IVDC-HB-01/2019的核苷酸同源性为99.99%至100%。在环境样本中发现SARS-CoV-2谱系A(8782T和28144C)。对新冠病毒阳性和阴性环境样本的RNA-seq分析显示，市场上有大量不同属的脊椎动物。总之，本研究提供了新冠暴发早期华南海鲜市场SARS-CoV-2分布和流行情况的信息。

综上所述，研究人员报告了市场西区环境样本中SARS-CoV-2RNA和活病毒的检测情况。研究人员注意到，选择商店进行采样有偏差，因为出售野生动物的商店以及与早期病例相关的商店优先进行采样。目前还无法从现有的所有分析中确定病毒的来源。由于每天的游客数量多，该市场仍然有可能成为病毒传播放大器，导致了疫情早期最初发现的许多感染聚集。

在此之前，一份研究报告假设，2019年11月或12月，SARS-CoV-2至少两次从动物传播给人类，浣熊犬（貉）被假设为中间宿主动物，然而，本研究提供的证据不足以支持这一假设。该研究证实了市场在关闭前存在貉和其他假设/潜在的SARS-CoV-2易感动物。然而，这些环境样本不能证明动物受到了感染。此外，考虑到回顾性报告的采样时间，在市场内人被感染后，研究人员认为也不排除人传播到动物的可能性。因此，目前尚不能排除通过受感染的人或冷链产品将病毒引入市场的可能性。

论文链接：

https://www.nature.com/articles/s41586-023-06043-2

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本文来源：生命科学前沿

转自：“科研大匠”微信公众号

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