《细胞》：对元转录组的挖掘揭示一个巨大的类病毒环状RNA世界

美国国立卫生研究院Eugene V. Koonin团队通过对元转录组的挖掘揭示一个巨大的类病毒环状RNA世界。

相关论文于2023年1月24日在线发表在《细胞》杂志上。

研究人员表示，类病毒和类病毒cccRNA是最小复制因子，通常不编码蛋白质并劫持细胞酶进行复制。类病毒的范围和多样性尚不清楚。

研究人员开发了一种用于识别类病毒共价闭合环（ccc）RNA的计算方案，并将其应用于5131个元转录组和1344个植物转录组。该研究获得了11378个类病毒cccRNA，涵盖4409个物种水平的类病毒元件，与之前确定的类病毒元件相比增加了5倍。在这个多样化的集合中，研究人员发现了许多假定的类病毒、卫星RNA、逆转录酶和核酶样病毒。

研究人员在ccRNA中鉴定出不同的核酶组合和独特的核酶。自切割核酶在ambiviruse、一些线粒体样病毒和衣壳编码卫星病毒样cccRNA中被鉴定出来。类病毒cccRNA在不同的转录组和生态系统中广泛存在，这意味着它们的宿主范围比目前已知的要广泛得多，并且与CRISPR间隔序列的匹配表明一些cccRNA在原核生物中复制。

相关论文信息：

https://doi.org/10.1016/j.cell.2022.12.03

转自：“小柯生命”微信公众号

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